一、退税时需要补税的总体原因

在办理个人所得税退税时，存在需要补税的情况是因为个人所得税缴纳采用预缴制，年度所缴纳的税款并不是最终应纳税额，当年度个人所得税预扣预缴税款比年度应纳税额少的时候，就需要补税。

二、导致补税的具体情况

收入来源相关有工资以外的收入：如果除了工资薪金之外，还有劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得等其他收入来源。这些收入在预扣预缴时可能单独计税，到年度汇算清缴时汇总计算，就可能导致应纳税额增加而需要补税。例如，一个人平时工资收入正常预缴税款，但同时有一笔高额的劳务报酬收入，预扣预缴时未足额缴纳，汇算时就可能要补税。

换工作：在年度中间更换工作单位，新老单位各自按照一定规则预扣预缴税款。新单位在计算预扣预缴时通常不会考虑之前单位已扣的税款情况，这可能导致全年预扣预缴的税款总额低于应纳税额，从而需要补税。

扣除项相关未足额申报专项附加扣除：如果纳税人有符合条件的专项附加扣除项目（如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等），但在预扣预缴阶段未及时申报或足额申报，到年度汇算时申报扣除后计算出的应纳税额可能增加，从而需要补税。比如，一个人有子女教育支出符合专项附加扣除条件，但在预扣预缴时未申报，年度汇算时补充申报后发现之前缴纳的税款少了，就需要补税。

扣除标准变化：税收政策调整，使得扣除标准发生变化。如果纳税人未能及时根据新政策调整自己的申报，可能导致预扣预缴与应纳税额不符，进而需要补税。

计税方式相关年终奖金计税方式：年终奖有单独计税和并入综合所得计税两种方式。如果在申报退税时选择的年终奖计税方式不合适，可能会导致需要补税。例如，原本选择单独计税时预扣预缴税款少了，年度汇算时若改为并入综合所得计税更合适，计算后可能需要补税。

其他特殊情况计算错误或疏忽：由于计算错误和疏忽造成的少缴税款和漏缴税款，应当补缴。一般来说，欠款应在3年内付清，在特殊情况下，可延长至10年。

纳税人违反税法：如果存在欠税、偷税、漏税等违反税法的行为，除补缴未缴纳的税款外，还会受到额外的罚款处罚，这种情况下也会出现需要补税的情况。